Genele care lipsesc sunt mai probabile la cei cu autism
Asta înseamnă că acei indivizi - 7% din grupul de studiu - au avut o copie a uneia sau mai multor gene atunci când ar fi trebuit să aibă două, au remarcat cercetătorii de la Școala de Medicină Icahn din Muntele Sinai din New York City.
"Aceasta este prima constatare că micile deleții care afectează una sau două gene par a fi frecvente în autism și că aceste deleții contribuie la riscul dezvoltării tulburării", a declarat cercetătorul principal al studiului, Joseph D. Buxbaum, Ph.D. , profesor de Psihiatrie, Genetică și Științe Genomice și Neuroștiințe.
„Această concluzie trebuie extinsă în alte eșantioane independente de TSA, astfel încât să putem înțelege cu adevărat cum se manifestă riscul.”
Acest proces este acum în desfășurare, potrivit Buxbaum. Autism Sequencing Consortium, format din mai mult de 25 de instituții, a primit o subvenție de 7 milioane de dolari de la Institutul Național de Sănătate pentru a continua analiza genomului a mii de indivizi ASD de pe Muntele Sinai.
Autismul, care afectează aproximativ 1% din populație, este o tulburare de dezvoltare considerată a fi cauzată de o interacțiune complexă între factorii genetici și de mediu. Deși tulburarea poate fi moștenită, majoritatea cazurilor de autism nu pot fi atribuite unor cauze moștenite cunoscute, potrivit Buxbaum.
În timp ce cercetările au indicat că ar putea exista până la 1.000 de gene sau regiuni genomice care contribuie la autism, majoritatea studiilor au căutat fie mutații punctiforme - o schimbare într-o singură literă de ADN pe o genă - fie zone extinse ale genomului , care cuprinde multe gene, care este modificat.
Pentru studiul lor, cercetătorii au scanat genomul a sute de indivizi folosind tehnologia secvențierii genelor. Au căutat variații ale numărului de copii mici - ștergerea sau duplicarea genelor - între indivizii cu autism și un grup de control al persoanelor fără tulburare.
Pentru efectuarea studiului, au folosit secvențierea exomei pentru a analiza toate cele 22.000 de gene umane din setul de probe. Apoi au analizat aceste date folosind programul eXome Hidden Markov Model (XHMM). Împreună, instrumentele sunt primele care pot găsi deleții sau adaosuri cu dimensiunea unei singure gene în genom, potrivit cercetătorilor.
Acest lucru ne dă puterea, pentru prima dată, de a efectua un test dintr-o probă de sânge și de a-l compara cu un genom de referință pentru a căuta mutații și variația numărului de copii mici la pacienți, a explicat Buxbaum.
Cercetătorii au analizat o bază de date formată din 431 de cazuri de autism și 379 de controale potrivite, totalizând 811 persoane. Au descoperit 803 de deleții genetice în grupul autist și 583 deleții în grupul control. De asemenea, au descoperit că cei cu autism au o probabilitate mai mare de a avea mai multe ștergeri mici.
„Se știe acum că numărul imperfect al copiei genetice este una dintre sursele majore de variabilitate între oameni”, a spus Buxbaum.
„Unul dintre motivele pentru care suntem diferiți unul de celălalt este din cauza adăugărilor de gene sau a ștergerilor, care sunt adesea moștenite. Dar dintre ștergerile suplimentare pe care le vedem în TSA, nu toate se datorează moștenirii genetice. Unele apar în timpul dezvoltării ovulului sau spermei, iar delețiile care se dezvoltă în acest mod tind să fie asociate cu tulburarea. ”
Cercetătorii au descoperit că o proporție semnificativă a ștergerilor genetice la cei cu autism au fost legate de autofagie, un proces care menține celulele sănătoase prin înlocuirea membranelor și organelor.
"Există un motiv întemeiat să credem că autofagia este cu adevărat importantă pentru dezvoltarea creierului, deoarece creierul produce mult mai multe sinapse decât are nevoie, iar excesul trebuie tăiat înapoi", a spus Buxbaum. „Prea multe sau prea puține sinapse au același efect de a nu face comunicarea să funcționeze foarte bine. Ar putea însemna că unele conexiuni sinaptice vin prea târziu și s-ar putea să nu se solidifice în mod corespunzător ”.
Cercetătorii spun că consideră descoperirile, publicate în American Journal of Human Genetics, va avea semnificație clinică.
„Variațiile numărului de copii cheie - cele care apar în mod constant într-o populație cu autism - pot avea impact asupra testării genetice”, a concluzionat Buxbaum.
Sursa: Spitalul Muntele Sinai / Școala de Medicină Muntele Sinai
